母亲被不明凶手杀害后，被自己的父亲——神圣布里塔尼亚帝国皇帝所流放、被人遗忘的皇子·鲁路修。他在被神圣布里塔尼亚帝国所支配的日本——11区隐姓埋名地生活着，为了总有一天能将冷眼对待母亲死亡这件事以及夺走了妹妹娜娜莉的双眼视力和双腿自由的神圣布里塔尼亚帝国打倒。当鲁路修从神秘的美少女C.C.那里得到了能对任何对象下达绝对遵守之命令的力量“GEASS”之时，他为了实现自己的野心而展开了行动——。