アメリカに渡り、ＮＡＳＡで学んでいた兜甲児が日本に戻ってきた。宇宙から訪れた未確認飛行物体の正体を探ろうと、甲児は人類の手によって開発された空飛ぶ円盤・ＴＦＯを発進させる。ＵＦＯは甲児を攻撃。突然の窮地を救ったのは、宇門大介ことデュークフリードと、謎のＵＦＯロボ・グレンダイザーだった。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション 脚本：上原正三　分镜/演出：胜间田具治　作画监督：小松原一男

地球にやって来た円盤・ミニフォーは、侵略目的で月に前線基地を設置したベガ星連合軍の尖兵だった。母星から指令を下すベガ大王を筆頭に、前線基地スカルムーンの最高責任者であるガンダル司令、攻撃隊長のブラッキー率いる円盤部隊が、地球侵略を虎視眈々と狙っていたのである。人類に立ち向かう術はあるのか？(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

大介はグレンダイザーを頼りに、ベガ星連合軍に立ち向かう決意を固めた。しかし、ベガ大王の恐ろしさを身をもって知る彼は、年に一度の楽しい牧場祭を前にしても、地球総攻撃の不吉な悪夢に悩まされてしまう。それでも隣の牧場の息子である荒野番太に手伝ってもらいながら、祭の準備に取り掛かるのだが…。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

甲児はTFOに武装を施し、自らも戦線に立とうとしていた。一方のベガ星連合軍は、フリード星の王子である大介を捕らえるために、隠れていそうな場所にしらみつぶしに攻撃を加えていた。大介が怒りに任せて出撃しようとすると、甲児が「それでは敵の思うつぼだ」と止め、ＴＦＯに乗り込んで代わりに戦おうとする。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

甲児が飛行機コンテストに出場することになった。シラカバ牧場から来たひかるや吾郎たちの応援にも熱が入る。だが、甲児のフライト直前になって、宇門博士と大介がベガ星連合軍の襲撃の兆しを察知。出場を辞退して帰還するよう伝えるが、順番の迫っていた甲児はそのまま出場する。その間にミニフォーが飛来して…。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

大介をおびき出すため、ガンダル指令は東京を攻撃するよう指示。観光バスに乗っていたひかると番太が、円盤獣に吸い込まれてしまった。甲児が二人を救出しようと、円盤獣の体内に飛び込む。グレンダイザーが一足遅れで到着するが、仲間の三人が円盤獣の内部にいるとなっては、迂闊に攻撃を加えることも出来ない。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

ベガ大王直属の親衛隊員であるゴーマン大尉が、マザーバーンにやって来た。彼はブラッキーを差し置いて、独断で地球攻撃計画に着手。大介がグレンダイザーで出撃して立ち向かうが、出世欲に突き動かされる大尉に退却させられたばかりか、発信機によって宇宙科学研究所の位置を突き止められそうになってしまう。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

大気圏外に広がる謎の雲を調査するべく、甲児がＴＦＯで宇宙に向かった。実はこの雲、グレンダイザーを孤立させて宇宙機雷で破壊するために、ブラッキーの仕掛けたレーダー遮断幕だった。そのことに気付いた時には既に遅く、ＴＦＯは操縦不能に陥る。甲児は何とか不時着させるが、着陸の衝撃で気を失ってしまう。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

新たなる刺客・コマンダーミネオ。彼女に与えられた任務は、グレンダイザーと共に自爆することだった。ルビー星出身の彼女は、ベガ星連合軍に侵略された母星の安全と引き替えに任務を引き受けたのである。だが、彼女はあえなく任務に失敗。乗り込んだミニフォーが墜落して傷を負っていたところを、大介に助けられる。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

新一少年は、宇宙人に会って円盤に乗せてもらう約束をしたことを、誰にも信じてもらえずにいた。彼はデタラメだとバカにした番太に仕返しをする。そのことを父親に叱られて走り去った直後、妙に素直な様子でシラカバ牧場に姿を現し、牧場内部を調べ回り始める。不審に思った大介が、こっそり後をつけてみると…。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

近付く日食を前にして、ガンダル司令は地球上の主要天文台を全て破壊するよう、ブラッキー隊長に命令を下した。日食が引き起こす磁気異常によって、グレンダイザーを動作不良に陥れようとする作戦だ。そんなことは知るよしもない大介は、作戦を開始したミニフォーを撃破しながら、誘き寄せられるまま宇宙空間に飛び出す。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

美雪岳測候所が襲撃される事件が起きた。調査に向かった大介と甲児は、現場で美雪という少女を保護。二人は彼女から事情を聞いて、事件の真相を究明しようとする。ところが美雪は、雪崩に巻き込まれた際に視力と記憶の一切を失っていた。残された通信記録から、ようやく円盤獣が背後にいると判明するが…。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

ベガ星連合軍はグレンダイザーをおびき寄せて倒そうと、市街地に円盤獣・ゲルゲルを放った。ゲルゲルは強固な装甲で全身を覆っているうえに、太陽エネルギーを熱線に変えて放射する能力を持っている。大介と甲児が駆けつけるものの、グレンダイザーが武器制御回路を破壊され、撤退を余儀なくされてしまう。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

かつてマジンガーＺやグレートマジンガーと共に戦ったボスが、子分たちを連れてシラカバ牧場に向かっていた。新年の挨拶をしに行くついでに、甲児と旧交を温めようというのだ。彼らは大介とも瞬く間に打ち解け合うが、道の途中でブラッキーに発見され、後をつけられていたことには全く気付いていなかった。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

コマンダーイアラは平和主義を信奉する科学者だった。彼は地震発生装置を開発しながら、それを戦争の道具にすることを拒んだために特別営倉に拘禁されてしまう。母を流刑星に送ると脅されたために、やむなく軍部に協力することを了承するが、それでも最後まで争いを避けようと、大介にある取り引きを持ちかける。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

美しく思慮深い女性・白川カオリは、宇宙科学研究所で働く林という男の恋人だった。ベガ軍の諜報員が彼女を利用しようと企て、脳波リモコン装置を使ってスパイに仕立て上げた。自分が操られていることにすら気付いていないカオリは、真夜中になると徘徊を始め、諜報員の意のままにシラカバ牧場を嗅ぎ回り始める。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

グレンダイザー攻略のため、ガンダル司令がシラカバ牧場の近くにある小山に前線基地を築き始めた。その頃、牧場では仔馬に運動をさせるため、一斉放牧が行われていた。ところが突然の吹雪に見舞われ、引き返そうとしたところを円盤獣に襲撃されてしまう。そのうえ仔馬のサンディが、あらぬ方向に逃げ出し…。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

エアロライトという巨大な隕石が、スカルムーンに接近していた。退避命令を出そうとするガンダルを、彼の中のもう一つの人格・レディガンダルが制した。エアロライトに誘導ミサイルを撃ち込むことによって、軌道をそらして地球に落下させようというのだ。その頃、大介たちは万吉という孤独な少年と出会っていた。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション

ブラッキー隊長が、月の引力を利用して地球を壊滅させる作戦を立てた。特殊な装置によって両者の重力の均衡を崩し、津波や地震を誘発させて人類を絶滅させようという、これまでにない大がかりなものだ。極秘裏の内に進められていた作戦は、ある登山客のスクープ写真によって、大介や宇門博士の知るところとなる。(C)ダイナミック企画・東映アニメーション