机动警察 十三号废弃物

2000年、東京湾に輸送機（フロンティア航空236便）が墜落し、乗員全員が死亡する事故が発生した。事故後、東京湾岸の各所で何者かによるレイバー襲撃事件が連続して発生し、警視庁城南署の刑事である久住と秦は各所で聞き込み捜査を進め、墜落事件の後に巨大なハゼが釣れていたこと、墜落した輸送機の貨物コンテナに不審な点があることなどを突き止める。

その後、6月8日の雨の夜に若者の集うディスコクラブ「バビロン」で、車に乗ったカップルの惨殺死体が発見される。時を同じくして、「バビロン」の近隣にあるバビロン工区の水上コンテナ備蓄基地で突如警報が作動し、施設内が停電すると共に内部の職員と連絡がとれなくなる事態が発生した。

近くを走行中のパトカー（城南4）に偶然乗っていた久住と秦は、警備員の通報を受けパトカーに乗る警官らと共に現場に急行。警備員たちと共に施設内部へと分け入った。しかしそこで彼らが遭遇したのは、廃棄物13号（WXIII）と名付けられた異形の怪物だった。