第1話　「メロスの戦士」 脚本：榎戸洋司　 二十世紀に人間とモンスターとの大戦争があった。 激しい戦いの末、勝ち残ったのはモンスターの方だった。 時は流れ新世紀、かつての戦争を忘れていった人間達、そんな中、学校で教わる教育に不満を抱く少年ボッカは、メロスの戦士、“黒船”と出会う・・・

第2話　「長い放課後のはじまり」 脚本：榎戸洋司 メロスの戦士“黒船”とモンスター “ホル”との戦いをまのあたりにしたボッカは、その最中に「忘却の旋律」を見る。 姿を消したつなぎじいさんの言葉に複雑な気持ちのボッカは、以前財布をすった謎の少女、小夜子と出くわす。

第3話　「白夜岬」 脚本：榎戸洋司　 年中オーロラが見えると言う一大観光地「白夜岬」 「忘却の旋律」の秘密を探す為、ここに住む有名な物知り婦人を探す事となるボッカ。 一方、スリのカモを探して一人の少女にターゲットをつけた小夜子は巨大なロボットに襲われるのであった・・・始まった・・・。

第4話　「モンスターユニオン」 脚本：榎戸洋司 生け贄の女の子“キュウちゃん”を襲ったのはモンスターではなく、モンスターに使える人間達 「モンスターユニオン」の仕業である事を知るボッカ。 そして謎のロボットを操る「モンスターユニオン」のエージェント“ミッドナイトひよこ”の正体はボッカ達のよく知る意外な人物であった・・・

第5話　「君に届く声」 脚本：榎戸洋司 モンスターユニオンと戦おうとするボッカは、わかだんと無数の大人たちの罠にかかり捕まってしまう。牢屋に入れられたボッカを助けに来た小夜子だが、逆にわかだんに見つかって一緒に檻に入れられるハメに・・・

脚本：榎戸洋司 「鼠講谷」にやって来るボッカと小夜子は巨大なダムに腕を挟まれている”謎の少年”とダムの壁面に絵を描き続ける”彦山絵師”に出会う 絵師の世話になる事になったボッカたちは、谷の有力者”金谷みり”に挨拶に赴くのだが・・・

第7話　「鳴弦」 脚本：榎戸洋司 谷に帰ってきた”遠音”という少女、子供たちの悲しみの涙を集める「働きマウス」たちを「鳴弦」という技で一瞬にして追い払う。 メロスの戦士であることが判明したのだが、遠音はメロスの戦士を憎んでいたのであった・・・

第8話　「すでに択ばれた遠い道」 脚本：榎戸洋司 モンスターユニオンとの戦いの傍らで語られる遠音と絵市の想い、そして”謎の少年”との出会い すれ違う人々の想いに隠された過去の因果を断ち切る為、今、遠音のメロスが鳴り響く！

第9話　「猿人湾」 脚本：榎戸洋司 沿岸にある工場が賊に襲われるという事件が、しばしば発生。困った工場長は、メロスの戦士であるボッカを見込んで、警備を依頼してくるが・・・

第10話　「ユニコーン・シリーズ」 脚本：榎戸洋司 モンスター・ユニオンに捕らえられた小夜子の救出に向かうボッカ。だが、武装演劇集団「チェンタウロ」のメンバーは、小夜子を見捨ててモンスターに奇襲をしかける。

第11話　「君がまだ知らない歌」 脚本：榎戸洋司 海上に浮かぶ「エンジン・ワン」。そこで、ボッカはモンスター・ユニオンのエージェント「ハッスルもんきー」と交戦状態に。そのとき、エンジン・ワンが突如動きだして・・・

第12話　「迷宮島」 脚本：榎戸洋司 小夜子の手首の鎖が指し示す島を目指して海を渡ったボッカたち。その島で、置き去りにされた黒船のアイバーマシン「ジャガーの太陽号」を発見する。

第13話　「黒船」 脚本：榎戸洋司 黒船を探し、迷宮島をさまようボッカ。彼はモンスターを見てもまったく動揺しない謎の少年・ソロと出会う。さまよい続けるボッカは、ついに黒船と再開するが・・・。

第14話　「出口という名の入り口」 脚本：榎戸洋司 黒船と分かれたあとも、迷宮をさまよい続けるボッカ。そんな彼を黒船の宿敵・ホルが襲撃してくる。ボッカの反撃もむなしく、ホルはソロをさらい姿を消す。

第15話　「幸運河」 脚本：榎戸洋司 「幸運河」に来たボッカと小夜子。そこでは多くの子供たちが誘拐されていた。モンスターユニオンの仕業か、調査するボッカ。その頃、川岸に一人の少年が流れ着いた。

第16話　「小夜子」 脚本：榎戸洋司 モンスターユニオンに捕らえられた小夜子を探すボッカ。途中ココら「チェンタウロ」のメンバーと偶然再会する。ボッカはココと二人だけで、敵の「水門塔」に侵入するが・・・

第17話　「天使でなくても持つ翼」 脚本：榎戸洋司 モンスターユニオンのエージェントの一人、ラッキーさらぶれっどに小夜子を人質にとられ、苦戦を強いられるボッカ。一方、ココは、フライングばにーと死闘を繰り広げていた。

第18話　「東京駅」 脚本：榎戸洋司 ボッカと小夜子は、東京駅中央停車場にたどり着いた。東京駅のど真ん中は、モンスターユニオンの勢力下。テント生活をしながら敵の情報を収集するボッカは、成果を得られず意気消沈。そこで小夜子が提案した気分転換とは？

第19話　「二十世紀戦争」 脚本：榎戸洋司 「マホロバ」の秘密を聞き出すため、総理大臣を誘拐したチェンタウロのメンバーは、ボッカ達が泊まるホテルにたてこもる。 そこでボッカは「二十世紀戦争」とモンスターキングの驚くべき事実を聞かされる。

第20話　「太陽が君を呼んでいる」 脚本：榎戸洋司 モンスターユニオンの「サイレント作戦」を阻止するため、ボッカ達は「マホロバ」を起動させるという決断をする。 戻れる保障のない旅立ちをしようとするボッカに対する、小夜子の一大決心とは？