自然に囲まれた成沢村に隣接する国道で、パトカーが不審車両の事故を発見した。 その翌日、高校生・深町晶と瀬川哲郎は、事故現場近くにある小さな沼で不思議な 物体を発見する。中心に金属球らしきものをはめ込んだ物体。 それに触れたとたん、物体から飛び出た何かが晶の身体を包み込んだ。 突然の事態に慌てだす哲郎。 その直後彼らの前に現れた謎の集団、そして、人とも動物とも思えない怪物。 彼らの目的は何か？　そして、晶に起きた異変とは？！ 脚本　　：武上純希 絵コンテ：越智博之 演出　　：越智博之 作監　　：松坂定俊

“ユニット”と呼ばれる謎の物体に触れ、強大な力を持つガイバーに殖装してしまった深町晶。あまりにも現実離れした状況に置かれた晶にとって、その全てを目撃した瀬川哲郎だけが唯一の救いだ。だが、哲郎は“ユニット”を狙う組織に顔を知られている。 これからどうすれば…。悩む晶たちの前に、事件を調べているという男たちが現れた。 警察が動き出したと安堵する二人に、男たちはその正体…生体兵器 獣化兵（ゾアノイド）としての姿を現す。 一方、唯一回収されたユニットが日本支部に届く。 静止も聞かず、乗り出したリスカーに、突如強殖細胞が…！ 脚本　　：武上純希 絵コンテ：須藤典彦 演出　　：泉明宏 作監　　：松岡秀明

秘密結社クロノス。獣化兵（ゾアノイド）。動いていない警察。事件を正しく伝えていない報道。これまでの状況を分析する哲郎の言葉に、晶は改めて自分が遭遇している恐怖を感じ始める。全ては闇に葬られてしまうのか。不安にかられた二人は、いつしか事件の発端となった場所…成沢山の沼に足を向けていた。 だが、そこにもクロノスの手は伸びていた。日本支部の命運を背負い、玄蔵の秘書・木村が現れる！新たなゾアノイドに苦戦する晶＝ガイバー。その時、ガイバーの新たな武器が発動する。そしてその影でほそく笑む者が・・・ 脚本　　：小林靖子 絵コンテ：和田高明 演出　　：齋藤徳明 作監　　：本田 隆、福田紀之、和田高明

突如 闘いの場に現れたもうひとりのガイバー。ガイバー（＝ガイバーII）と名乗るその男は、“ユニット”の正体をあかし、晶（＝ガイバーI）をクロノスへと誘い、激しい闘いが始まる。 同じガイバーとはいえ、明確にある力の差。 辛くもその場から離れた晶（＝ガイバーI）と哲郎は、周囲の人たちを如何に巻き込まないようにするか考え始める。 しかし、新たな戦いの場になったのは、一番恐れていた場所…晶たちが通う学校だった。そこでは、クロノス本部から 総司令リヒャルト・ギュオーが連れてやってきた、超獣化兵（ハイパーゾアノイド）ゼルブブスとの戦い。 これまでの敵とはまるで違う手応えに、ガイバーIは戦慄する！ そして、ついに最悪の悲劇が起きる。 脚本　　：植田浩二 絵コンテ：康村諒 演出　　：康村諒 作監　　：高瀬言

朝のニュースを見て、晶と哲郎はクロノスの裏工作を確信する。 学校は暫らく閉鎖となり、生徒会役員である晶と瑞紀もその準備に追われる。一緒に帰ろうとの誘いをかわされ、顎人に見咎められた晶は、仕方なく哲郎と帰路に着く。その途中、哲郎から顎人が養子である事を知る晶。 調整槽に浸かる義父・玄蔵を冷徹に見る顎人。 突然、店内でコンタクトしてきた獣化兵。 咄嗟に殖装し、哲郎と共に飛び出すガイバーI。敵を撒けた……そう思った瞬間、見えない攻撃が2人を襲う。 音を武器に、2体で連携攻撃してくるハイパーゾアノイド・ノズコフ＆ムメルゼー。 攻撃に追われたガイバーIと哲郎が高架下に逃げ込んだ時、突然周囲の音が…！ 脚本　　：ほそのゆうじ 絵コンテ：井之川慎太郎 演出　　：井之川慎太郎 作監　　：松坂定俊

遂に瑞紀を巻き込んでしまったと悔やむ哲郎と晶。 ただ現実を誤魔化す事しか出来ない彼等に代わって、瑞紀を救ったのは顎人の作られた優しさだった。 完成する、対ガイバー実験用試作ゾアノイド“エンザイム”。 義父である玄蔵の変わり果てた姿にも、ただ一瞥するのみの顎人。 疲れ切って寝入る晶の元に、クロノスからの召喚状が届く。 恐怖に慄きながらも、共に帰ると約束した晶と哲郎は、いざ成沢山に向かう。 あらゆる憎しみを力に変えたエンザイムは、死に物狂いでガイバーに襲い掛かる。 血で血を洗う、生命をとした戦いが、今、始まる！ 脚本　　：高橋ナツコ 絵コンテ：八谷賢一 演出　　：佐々木勝利 作監　　：金 相

クロノス日本支部に回収されるガイバーIのコントロール・メタル。 再調整を施され、更なる能力を付加されたゼルブブスは、リスカーを侮蔑する。 囚われた哲郎は、ギュオーからクロノスの野望と人類創生の秘密を聞かされる。その言葉をすぐには理解出来ない哲郎。だが、晶がいなくなった現実を実感しつつ、その発端が自分のせいだと悔やみ、一人独房で悲嘆に暮れる。 瑞紀もまた、先日起きた事件のことを思い出し、恐怖のあまり一人病院で震えている。 その時、完全に活動停止しているはずのコントロール・メタルが、突如動き出す！それを見て、ほくそ笑むガイバーIII。 混乱の中、身を竦める哲郎の目に飛び込んで来たものは･･････？！ 脚本　　：武上純希 絵コンテ：小林一三 演出　　：西山明樹彦 作監　　：南伸一郎

哲郎の前に現れたガイバーI。 理由はわからなくとも、感極まる哲郎に対し、晶はエンザイムに倒された後の記憶を持っていなかった。共にクロノス日本支部から脱出を図る2人は、上へ、上へと逃げて行く。 混乱にまぎれ、自爆シークエンスを発動させる顎人。 リスカーに疑惑の目を向けつつも、日本支部の放棄を決定するギュオー。 屋上へ辿り着いたガイバーIと哲郎は、そこにいたギュオーから“降臨者”の事を聞きだす。爆発まで数分。いざ脱出するガイバー?Tと哲郎。 その直後、2人の前にガイバーIIが現れ、戦いを挑む。 戦いの最中、またしてもコントロール・メタルが･･････？！ 脚本　　：小林靖子 絵コンテ：深沢幸司 演出　　：青柳宏宣 作監　　：本田 隆、福田紀之

早朝、自宅に帰ってきた晶は、テーブルに突っ伏して眠る史雄の姿を見て、嬉しさと申し訳なさとが入り混じりながらも、部屋へ入ってしまう。 いつも通り朝食を囲む2人。 何気ない会話の中にある優しさを感じつつも、気遣う故に擦れ違う父子。 退院する瑞紀を迎えに行く晶と哲郎。晶は「瑞紀にだけは黙っていて欲しい」と哲郎に懇願する。その気持ちに哲郎は気付き、うなずく。 帰宅する顎人を待つ客、それは何とギュオーだった。 自宅で父の帰りを待つ晶を、不意にパナダインが襲う。 危機に陥ったガイバーIの前に現れたのは、巨大な銃を持つ謎の男。 戦いが終わり、ガイバーが殖装を解いた時･･････？！ 脚本　　：植田浩二 絵コンテ：泉 明宏 演出　　：泉 明宏 作監　　：手塚勇人、篠田 章

瑞紀に正体を見られてしまい、立ち尽くす晶と哲郎。静寂の中、哲郎の携帯に史雄から晶の身を案じた電話が入る。しかし、その最中、史雄はクロノスに拉致されてしまう。遂に、晶の周囲に狙いを定めたギュオー。 顎人はギュオー抹殺を決意し、殖装する。 決然と父・史雄の救出へと走り出す晶を見送る哲郎と瑞紀。 哲郎から全ての事情を聞いた瑞紀は、影で自分を守ってくれていたのが晶だと理解する。その時、史雄に続き、哲郎と瑞紀も工作員に取り囲まれる。 それを指示していた者は･･･？！ ガイバーを待ち構えていたのは、ロストナンバー・コマンドの3人。その内の一人が変身した姿は、何とガイバーだった！動揺し、苦戦を強いられるガイバー?Tに、村上の助言が飛ぶ！ 壊されていく日常にガイバー?Tは膝を落とす･･･。 脚本　　：ほそのゆうじ 絵コンテ：康村 諒 演出　　：佐々木真哉 作監　　：高瀬 言

村上の車に乗り、魅奈神山へと向かう晶。車中で聞くレリックスポイントの実態。 そして、ユニットが発見された場所でもあることも聞く。 基地内を連行される哲郎はその規模に瞠目する。牢獄内で、史雄は哲郎から初めて息子の状況を聞かされる。ショックを乗り越え、労わりを示す史雄に、感激する哲郎と瑞紀。哲郎たちの前に現れた顎人は、自分の真意がクロノス打倒にあり、そしてガイバーIIIであることを明かす。 哲郎たちを連れ、基地からの脱出を図る。 その様子を忌々しい表情で見ているギュオー。リニアラインを歩くガイバーIII達の前に、ゼクトール率いるハイパーゾアノイド5人衆が現れる。翻弄されるガイバーIIIを前に、戦慄する哲郎たち。 その時、土砂をぶち抜き、姿を現した者は･･･！ 脚本　　：高橋ナツコ 絵コンテ：八谷賢一 演出　　：齋藤徳明 作監　　：松坂定俊

5人衆の攻撃をかわし、何とか地上に逃れる一行。 そこで初めてガイバーIIIの正体を知る晶。息子の異形の姿を目の当たりにする史雄。しかし次の瞬間、またしても史雄がさらわれてしまう。 ガイバーIはエレゲンの電撃をコントロール・メタルに受けてしまい、そのショックで殖装が解け、昏倒する。 互いの胸中を探り合う顎人と村上。 しかし、一同を別荘へ誘うことを決意する顎人。そこで待っている者は、顎人と強い絆で結ばれている志津と与平だった。 昏睡から目覚めた晶は、父を感じ、父を想い、哲郎たちの目を盗み、父救出へと向かう。その後を追って来るものは…？！ 脚本　　：小林靖子 絵コンテ：矢野博之 演出　　：佐々木勝利 作監　　：金 相

ガイバーIはガイバーIIIの先導の元、史雄救出のためレリックスポイントへと潜り込む。再会する父子。共闘しながら、無事地上へと脱出する2人。 喜ぶガイバーIとは裏腹に、不審がるガイバーIII。その時、2人の前に、5人衆の内3体、ゼクトール、エレゲン、ザンクルスが姿を現す。 父を背負うガイバーIを気づかい、先に行かせるガイバーIII。 一方、別荘では村上が5人衆の残り2体の襲来を察知していた。ダーゼルブとガスターは、村上の思念波に操られ同士討ち寸前になるが、バルカスに助けられる。やむを得ず、獣神変する村上。 その姿にしたダーゼルブとガスターは撤退を命じられる。 ひた走るガイバーIの背中で、幼き頃の思い出を語る父・史雄。その史雄の背中から、突如触手が生え、ガイバーIを襲う！ 困惑する史雄に、バルカスからの思念波が響く！！ 脚本　　：植田浩二 絵コンテ：越智博之 演出　　：青柳宏宣 作監　　：久高司郎、福田紀之

昏睡し続ける晶。 一同は追撃から逃れるべく、別荘から慌ただしく立ち去る。 途中、木陰で善後策を話し合いながらも、一人疎外感を感じてしまう瑞紀。そこに、3体のエンザイムIIが迫りくる。 殖装して戦おうとするガイバーIIIは、酵素液にやられてしまう。 投げ飛ばされる車から間一髪で殖装し、脱出するガイバーI。 しかし、エンザイムIIの姿を見た瞬間、殖装は解除されてしまう！ 晶を庇い、更に重傷を負うガイバーIII。銃も壊され、に村上たちは、絶体絶命のピンチに陥る。 村上は自分の身体を気遣いながらも、みんなを守るため、またしても獣神変を叫ぶ！ 脚本　　：武上純希 絵コンテ：小林一三 演出　　：西山明樹彦 作監　　：南伸一郎

殖装することが出来なくなった晶。 村上は改めて、ガイバーの、降臨者の、そして人類の秘密を語る。 外宇宙から飛来した異星人。生態系を操作し、兵器の素体として生み出された生命。 ゾアノイドを統率するゾアロードの存在。 信じ難い現実を聞かされ、いたたまれなくなった瑞紀は、一行の元を離れる。 晶は戻らぬ瑞紀を心配し、探しに駆け出す。拙い言葉で瑞紀を慰める晶。 その一部始終を、木の上から監視するアプトム。 話し合いの最中、突如村上が激しい反応を示す。 それは、謀反の発覚を恐れ、自ら出撃してきたギュオーの姿だった！！ 脚本　　：高橋ナツコ 絵コンテ：伊藤真朱 演出　　：伊藤真朱 作監　　：高橋成之

爆発跡地にギュオーの姿を見る晶と瑞紀。 仲間の事態を確かめる間も無く、現れたクロノスの一隊から逃げる2人。 指揮を執る4人衆、ゼクトール、ダーゼルブ、エレゲン、ガスターは、村上、ガイバーIIIの遺骸と晶の捜索を開始する。 その最中、通信機を捨てたアプトムの真意とは･･･。 晶と瑞紀は、獣化兵に取り囲まれるが、行方不明と思われていたガイバーIIIに助けられた。洞窟で瑞紀と共に、殖装出来ない理由を模索する晶。 瑞紀が史雄の件に触れた途端、晶の封印していた記憶が揺さぶられる。そこへ現れるガイバー?V。だがそれは、アプトムの偽りの姿だった。アプトムは瑞紀を人質に取り、晶に殖装する事、そして自分と戦うことを求める。 瑞紀を助けたい！その強い想いが、再び晶をガイバーへと導く！ 脚本　　：ほそのゆうじ 絵コンテ：柳沢テツヤ 演出　　：泉 明宏 作監　　：手塚勇人、篠田 章

アプトムとの戦いを終え、瑞紀の元へ戻る晶。 対戦跡地を検証する4人衆、ゼクトール、ダーゼルブ、エレゲン、ガスター。その時、バルカスからの思念波が響き、形式不明のゾアノイドのことを聞かされる。突然、エレゲンに取り付く何者か。それはエレゲンの身体を侵食し、バルカスにコンタクトを求める。その正体は、クロノスに決別を告げるアプトムだった。 人ごみに紛れ込むべく竹代町へと逃げる晶と瑞紀。 しかしそこは、町自体がクロノスの支配下になっていた。思念波に操られ、次々と獣化する民間人達。彼等を殺すことが出来ず、瑞紀と共に追い詰められるガイバーI。 その時現れたのは、躊躇無くゾアノイドを一掃していくガイバーIIIだった！ 脚本　　：杉原由紀 絵コンテ：井之川慎太郎 演出　　：齋藤徳明、井之川慎太郎 作監　　：松坂定俊

クロノスの基地内を抜け、最下層に辿り着く晶と瑞紀と顎人。そこには、変わらぬ姿で待っていた仲間たち。ただ、村上だけは、ギュオーとの闘いで、力を使い果たしてしまい、プロトゾアロードの姿のまま、昏睡し続けていた。 その脱出劇の最中、小田桐主任と出会う顎人達。 小田桐主任とその部下達は、レリックスポイント最下層で長年、秘かにクロノスへの反意を抱き、チャンスを窺って来た。それは山村教授から続く、十年以上に渡って受け継がれてきた意思。 同最下層の白井博士の研究室へ訪れ、不穏な動きを見せるギュオー。 突然、遺跡の生命反応上昇と共に、ギュオー、バルカスのゾアクリスタルが共振を始める。 その時、村上の額もまた輝きだす！ 脚本　　：植田浩二 絵コンテ：和田高明 演出　　：濁川浩二 作監　　：金 相

意識を回復した村上に、喜ぶ一同。皆が自分の役割を見出す中、村上の世話を志津に申し出る瑞紀。瑞紀は村上と言葉を交わす内、晶に通じるものを感じ、親しみを覚える。 ギュオーは白井博士にリムーバーの解析を急がせる。 一方、十二神将はギュオーの謀反を知り、粛清を決定する。 村上を介護する最中、彼の寿命が残りわずかであることを知ってしまう瑞紀。晶には言わないでくれと懇願する村上。 アプトムは魅奈神山周辺で、工作員の融合捕食を繰り返すが、更なる力を求めレリックスポイントに向かう。途中、謎の少年に遭遇し、圧倒的な力を見せられ、慄くアプトム。 作戦実行に向けて、着々と準備が進む中、泣きじゃくる瑞紀。 いざ遺跡突入するべく並び立つ晶と顎人は、決意を胸に殖装する！ 脚本　　：小林靖子 絵コンテ：志村錠児 演出　　：飯島正勝 作監　　：佐藤和巳

工作員姿となり、レリックスポイントに侵入するアプトム。 ギュオーの前にアルカンフェルが立ち塞がり、リムーバーを差し出すよう促す。 2人のガイバーは探査用バックパックを背負い、遺跡内部へと踏み出す。コントロール・メタルに反応して入口を形成する遺跡。溶液に満たされた不思議な空間を、2人は突き進む。 決死の覚悟でアルカンフェルに背き、リムーバー目指して基地内を逃げるギュオー。 2人のガイバーは遂にメインブリッジに辿り着く。その時、遺跡の生命反応が急上昇し、今まさに数万年の眠りから目覚める。 抗うことさえできず、中央にあるナビゲーション・メタルに引き寄せられるガイバーＩ。分解されるコントロール・メタルを、ただ愕然と見る一同。 だがそれは、遺跡を操作する方法だった！ 脚本　　：高橋ナツコ 絵コンテ：佐々木真哉 演出　　：佐々木真哉 作監　　：高瀬 言