ちょっぴりドジで泣き虫な中学２年生の月野うさぎ。 額に三日月模様を持つ黒猫ルナに出会って渡されたのは、不思議なブローチだった......！

ひょんなことから、IQ300の天才少女水野亜美と急接近したうさぎ。 亜美の通う塾の生徒が何やら怪しい様子だが……。

うさぎのまわりでは仙台坂上のバスの不穏な噂で話題がもちきり。そんな中、うさぎは黒髪の美しき巫女、火野レイと出会う。

宝石産出国、D国のプリンセスが秘宝を披露するということを聞きつけたうさぎ。 秘宝が幻の銀水晶でないかとにらみ、D国大使館に忍び込むが……！

訪れた男性が行方不明になるという「呪われたブライダルショップ」。そんな噂で持ちきりの十番中学校に長身の怪力少女、木野まことが転校してきた！

幻の銀水晶を探し、犯行を続けている人物として報道されたタキシード仮面。ルナたちはタキシード仮面は敵だと疑うが、うさぎは信じられずにいて……。

タキシード仮面の正体が地場衛であることを知ったうさぎ。一方うさぎの住む街では、洗脳された人々がセーラームーンを捜し求めて徘徊していた……。

セーラームーンのピンチを救ったのはなんとセーラーVだった。セーラーVこと愛野美奈子は、クンツァイトと決着をつけるため東京タワーに向かうが……！

セーラームーンをかばい意識を失うタキシード仮面。悲しみの感情によって、セーラームーンがプリンセス・セレニティとして覚醒する……！

幻の銀水晶の謎をつきとめるため月に降り立つセーラームーンたち。そこで出会ったのはなんと前世のうさぎの母、クイーン・セレニティだった……！

悲しみに暮れるうさぎの前に現れたのは「遠藤」と名乗る、衛そっくりの男性だった。うさぎは衛の面影を感じ、その男性に近づくが……。

衛がダーク・キングダムの戦士となってしまったことを知らされるセーラームーン。衛を取り戻すべく、クイン・ベリルに立ち向かうが……！

悲しき運命を終わらせるべく、聖剣を衛に刺した後、自害をするセーラームーン。倒れた２人はクイン・メタリアに飲み込まれるのだった……！