つかの間の平和な日々のなか、「先祖がえり」という怪物現象が起こり街は騒然となる。うさぎ達は新設の無限学園へと偵察に向かう。

ちびうさは「土萠研究所」へ迷い込み、発作で倒れこんでいる少女と出会う。突如怪物に襲われるちびうさと、うさぎ。そんな中、新しいセーラー戦士の影が!

うさぎ達は無限学園の新入生合宿へ潜入。真夜中、魂と生気「オスティ」を捧げさせる怪しい儀式を行う有村ゆうこを見つける。新しい敵デス・バスターズとの戦いが始まる!

うさぎ達は無限学園で開催される海王みちる、羽生美々のコンサートへ。コンサートでは美々がミメットに変身し、大混乱となる!

無限予備校で常に模試1位の美堂ゆいの挑発をうけ、無限学園に体験入学した亜美は敵に捕まってしまう。伝説の外部太陽系戦士、彼らの真の目的とは?

照野留々が改良したテルルンという植物が生命エネルギー「オスティ」を吸い取ることを知ったまことは、うさぎ達と急ぎ無限植物園へ向かう。

土萠ほたるの秘密を見てしまったちびうさ・・・仲の良い二人の心に亀裂が。そして謎に包まれた外部太陽系3戦士の真実が語られる。

シプリン・プチロルの魔力に惑わされセーラー戦士達が互いに戦い合う中、突如3つのタリスマンが共鳴しあい、かつて無い現象が起こり始める。

セーラーサターンの覚醒を阻止するため、ほたるを殺すと宣言するウラヌス。ほたるを守ろうと駆けつけたちびうさが、逆に「幻の銀水晶」を奪われ・・・そしてついに、ほたるが!?

一刻も早く魂を取り戻さなければ、ちびうさは死んでしまう。超生物と化した土萠教授と戦うセーラー戦士達、そのさなか変わり果てた姿のほたるを見つける。

師ファラオ90の攻撃から、結界を張り必死で守る外部太陽系戦士達。そして命がけでちびうさの魂を守ろうとするほたるの意識が・・・。

セーラー戦士達が力尽きる中、スーパーセーラームーンが「幻の銀水晶」の力を解放しようと自ら師ファラオ90へ飛び込む。そして３つのタリスマンが共鳴し始め・・・!?

サターンの「沈黙の鎌」が振り下ろされ、セーラームーンも消えた。世界の終焉を覚悟したその時、ひとつの光の塊がゆっくりと現れた!