人类迎来了全新的变革，在其背后出现了被称为数码暴龙的可怕生命体，天马得知同班同学被冻结后情绪激动，他认为此事与自己有关，此时，天马的辅助蛋突然发光，守宫兽出现了。

一只神秘的数码兽出现，吃掉了天马智郞。这只来历不明的数码兽口中更说出了小瞳的名字。另一边厢，智郞遇见清道夫「闪耀黎明」队长泽城京，泽城京的一句话让智郞大吃一惊。

智郞和月光壁虎兽中了鬣狗兽的计，进入了网络的虚拟空间镜中世界。智郞决心要夺回小瞳的辅助蛋，让她恢复如初。

玲奈对京委托的下一项工作充满热情。然而，由于智郞的失误，马赫兽逃脱了。身为新人，智郞无法理解玲奈对「闪耀黎明」团队的执着。

智郎在光之滨东商店街看到有人闹事，此时，熊猫兽出现了。月光壁虎兽多了一个新朋友，对方说要和物成为平起平坐的兄弟。

熊猫兽对老板被伤感到愤怒，但牠内心却在自己的情感和骑士精神的教诲之间摇摆不定。明天，牠准备想阿斯塔兽发起挑战。

玲奈一行人發現了一位被數碼獸襲擊、濒臨「冰心」的登山者。他們雖然確定是數碼獸所為，但卻不知道數碼獸沒有把人吸到徹底凍結的原因。

最近接二連三地有高中生失蹤，事發地點是智郎的學校。智郎和瞳一起寻找失蹤的亞子。

閃耀黎明成員潛入香格里拉蛋，抓捕通緝犯。他們誤進了一個危險的地方，黃金鼻涕獸出現了。

誠的兜帽蝠獸被春子帶走了，春子把數碼獸當成玩具。誠因為自己的軟弱導致兜帽蝠獸受苦而感到苦惱。

智郎外出為飛鳥購買生日禮物，卻因為圍巾的選擇和月光壁虎獸發生了爭執。與智郎分別後，月光壁虎獸悶悶不樂，這時一隻會釋放毒氣 的數碼獸出現在他面前。

智郎后悔自己害到京和月光壁虎兽受伤，他开始重新面对自己作为清道夫的工作。

五行星齐聚一堂召开会议，议题是心冻症事件增加和灾难级数码兽出现。与此同时，智郞和他的朋友们遇到了三个奇怪的人。

怀恨在心的战术小组趁着京不在，企图把闪耀黎明全部猎杀殆尽。传说中最年轻的战术小组对上壁虎月光兽等人，但是...

怀恨在心的蘑菇团决心要打败闪耀黎明。红鼻屎兽制服了月光壁虎兽等数码兽，剩下的幼年期数码兽只能在暗处观望...

玲奈和格拉尼特被傅送到一座寒冷的雪山。尽管他们不和，但也一起寻找能脱身的线索。

在追捕的过程中，闪耀黎明和战术小组发生了冲突。萤子的弟弟妹妹们刚好也在场，误 把阿诚当成了萤子的同事，邀请他到自家的大阪烧店吃饭。

智郎等人发现了一个晕倒的男子，并为他做了火锅。战术小组要求闪耀黎明交出该男子，在危急之下，他丢下了自己的数码兽。

智郎一行人发现外界正流傅著世界知名慈善家克莱·阿尔斯兰所举办的慈善拍卖会，背后其实另有内情，于是接受国民保护省的委托，到拍卖会现场进行调查。

智郎和月光壁虎兽被猴子数码兽带走，进入了镜中世界的竞技场。他们发现有人在用数码兽的战斗做赌局...