妖邪界袭击35年后，以柳生娜斯蒂为中心成立的“防卫特殊案件对策总部”（通称DST），正致力于强化防卫力量并培养肩负下一代的铠传战士。为了防备妖邪界可能再次入侵的那一天…… 而这一天终于到来了。连接妖邪界与人间界的门突然出现，妖邪开始入侵人间界。北条武藏等现任铠传战士们勇敢地迎接这一紧急事态。 然而，在口中哼着怀旧金曲的残忍妖邪面前，他们完全束手无策……

此番，为毁灭人界与妖邪界，来自天导界的阴冥现身于此。在他身旁，是一身天导界装束的龙成。而夺取凯的肉身得以复活的罗真我，将矛头对准了阴冥与龙成，战局愈发陷入混乱胶着。龙成投向凯一行人的冰冷目光，其真正用意究竟为何。面对摆在眼前的残酷现实，他们又将做出怎样的抉择 ——。

英雄凯再度身披霸皇帝，回到了凯一行人的面前。达成压制妖邪界这一目的的阴冥释放出威力强大的天业，与龙成一同离去。士兵与十勇士从正在崩塌的妖邪界仓皇逃离。众人回到人界后，来自天导界的四兽士 —— 古冥、死冥、骸冥，挡在了他们的去路。四兽士此番前来，目的是夺回霸皇帝。凯一行人陷入苦战，就在这时，不知从何处，有声音向凯呼唤而来 ——。

紫音与龙成在充满回忆的地方对峙。紫音想要探明对方的真实心意，换来的却是龙成冷漠的态度。曾一同度过训练岁月的二人，将会道出怎样的话语。 就在此时，佐助知晓了寄宿于凯体内的祢津等人姓氏一族的存在，下定决心要助凯一行人一臂之力。 联合训练就此展开，可佐助一众始终找不到战斗的意义，训练之时完全无法投入心神。见状，紫音向佐助他们提出了一个方案。那正是紫音自己过去对战斗的理由感到迷惘时，亲身经历过的办法 ——。

吸收人类生命力而化作漆黑形态的霸皇帝，不断折磨着凯。面对阴冥陷入绝境的凯，出手相救的竟是本应站在敌方的龙成。从背后刺穿阴冥的龙成，其真正的用意究竟为何 ——。与此同时，天导界开始搜寻完成真正霸皇帝所必需的“霸业之盾”。各方心思盘绕交错，战斗的走向朝着出人意料的方向发展 ——。

紫音为了覆灭印冥，代替龙成献出了生命。继承这份意志的龙成，再度披上闪光铠甲。再次启动的霸皇帝反弹了霸者勾玉的力量，成功击退印冥。然而代价太过沉重，无人能为这场胜利感到喜悦。众人皆沉浸在失落之中，凯前往纳斯蒂处寻求指点，得知紫音在开战前曾来找过纳斯蒂。紫音当时倾诉的心意究竟是什么。而再度奋起的凯一行人所选择的答案又是 ——。

凯一行人背负着紫音的心愿，下定决心连紫音的那份一起战斗，他们压制住盖梅召唤出来的怪物，与第一关隘的守门人盖梅展开战斗。面对惊人的力量，凯等人陷入劣势、身处绝境，佐助一行人及时赶来支援。一直在持续修炼以习得奥义的他们，能否真正成为英雄？又能否成功施展奥义——。

习得奥义的佐助一行人成功击败盖梅，刚刚开始产生默契的凯等人，却因罗真我暗中谋划而被分割成两股势力。魁人一行人被俘的第二关隘处，四兽士中唯一的女性——希梅挡在他们面前，众人被迫迎接没有凯参战的这场试炼。另一边，西造等人与再度夺走凯身体的罗真我对峙。印梅夺走了盖梅胸口的水晶，萨古梅不惜损耗自身推进计划。怀揣各自的盘算，一场赌上真正霸皇帝之位、前所未有的生存之战就此拉开序幕——。

佐助仿佛被阴冥指引着，前往西造等人所在之处，映入眼帘的却是无可替代的同伴们面目全非的模样。面对极尽暴虐的罗真我，怒火中烧的佐助向其发起单挑。阴冥现身于五冥把守的关卡，企图夺取最后一块水晶。索古梅依靠掠夺而来的人类精气恢复力量，为完成自身肩负的使命挺身而出。就在此时，心系凯与十勇士的魁人一行人，将要面对的是——。

以十位勇士的性命为代价，霸业之盾得以完成，罗真我距离实现野心越来越近。萨古梅为粉碎这份野心，借助夜户神人强大的力量向罗真我发起挑战。另一方面，在凯的精神世界中苏醒的魁人们，为了让凯复活而奋力拼搏。在此，萨古梅的真实意图与凯的身世真相得以揭晓。激烈的战斗迎来最终阶段，魁人们为促成真正霸皇帝的诞生，不得不面临极限抉择——。

因吸收最后一块水晶而变身成最终形态的阴冥，无情地剥夺了凯与萨古梅父子重逢的时光。回忆起自身身世与母亲爱意的凯装备上霸业之盾，完成了真霸皇帝。阴冥复活了破坏神夜斗神人，围绕真霸皇帝的最终之战就此拉开序幕。凯等人拼尽全力奋起迎战，就在他们即将在压倒性的力量面前溃败之时，不知何处传来了呼唤凯一行人的声音——。

凭借全部奥义绽放出金色光辉的霸王皇帝。那身姿，正是八咫魔神所期盼的真正霸王皇帝。来自人界传递至凯一行人耳边的声援、辽等人的心意，还有十勇士的支援。为夺回和平的世界，众人向史上最强的敌人发起挑战——。 历经无数次战斗，数次身负创伤，却一次次站起并不断成长的武士军团。手握真正的力量，为各自的信念奋勇疾驰——。