人類と冥獣との戦争、ディストニア戦争終結から3年。大戦の英雄だった大鳥居あすかは魔法少女を退役し、女子高生としての生活を送っていたが、ある日街でテロが発生し……。 脚本：海法紀光　絵コンテ・演出：山本秀世　作画監督：氏家嘉宏

再び魔法少女へと変身し、テロリストから友人を守ったあすか。そんな彼女へ、同じマジカル・ファイブだった夢源くるみの情報が入る。彼女は今もなお、戦いを続けていた。 脚本：海法紀光　絵コンテ：山本秀世　演出：駒屋健一郎　作画監督：清水勝祐

転校してきたくるみを迎え、あすかは友人たちとプールに遊びに行くことに。魔法少女としての戦いの日々から遠ざかり、穏やかな日常に浸るあすかであったが……。 脚本：海法紀光　絵コンテ：山本秀世　演出：ながはまのりひこ　作画監督：小山知洋

監禁され、アビゲイルたちに拷問を受ける希美。希美が誘拐されたことを知って焦るあすかだが、公安もM班も動けない状態にあった。それを聞いたあすかは……。 脚本：小太刀右京　絵コンテ：山本秀世　演出：川久保圭史　作画監督：輿石 暁

魔術傭兵のコンビを前に苦戦するあすか。一方、くるみの応急処置もあり希美は一命をとりとめる。しかし、希美の負った傷は外傷以上に精神を蝕んでおり……。 脚本：霜山航太郎　絵コンテ：山本秀世　演出：山本秀世、藤本義孝　作画監督：Cindy H. Yamauchi

バベル旅団の情報を追って日本へやって来たミアは、ジュリア、アーロンと共に潜入調査を行う。一方、あすかは近所の七夕祭りでサンディノという気さくな女性に出会う。 脚本：小太刀右京　絵コンテ：山本秀世　演出：藤代和也　作画監督：中岡響香、なまためやすひろ、山村俊了、小澤 円、輿石 暁

Ｍ班に加入したあすかの最初の任務は、北海道でのロシアン・マフィアとの戦闘。そこにマジカル・ファイブのタマラが関わっている可能性も示唆され、出動するものの……。 脚本：深見 真　絵コンテ：山本秀世　演出：駒屋健一郎　作画監督：池田志乃、佐野陽子、森 悦史

沖縄で父親から虐待を受ける少女、与那嶺ちさと。ある日、彼女はバベル旅団のギースによって魔法少女となる。そしてあすかたちも時を同じくして、沖縄へ向かっていた。 脚本：深見 真　絵コンテ：黒川智之、宮澤良太　演出：ながはまのりひこ、有冨興二　作画監督：小山知洋、角谷 理