バージョンアップしたＧＢＮで、１人傭兵プレイを続けるヒロト。そんな彼に声をかける、カザミと名乗るダイバー。俺と組もうという提案にとりつくしまもなく拒否されたカザミだったが、めげる様子は一切見せない。彼の目的は、噂の隠しミッションの攻略だった。 脚本：むとうやすゆき／絵コンテ：綿田慎也／演出：綿田慎也／キャラクター作画監督：戸井田珠里／メカ作画監督：久壽米木信弥、宇田早輝子

フレディが伝説のフォースと息巻く「ビルドダイバーズ」を名乗らざるを得なくなったヒロト達。メンバーが様々な反応を見せる中、ヒロトだけがその名前に特別な感情を抱いていた。そんな中、再びフレディのミッションをプレイすることになった４人。フレディは彼らを自分が住む村へと招待する。 脚本：むとうやすゆき／絵コンテ：大久保朋／演出：大久保朋／キャラクター作画監督：小谷杏子／メカ作画監督：大張正己

フレディの村を守るミッションを受けることになったビルドダイバーズ。事前に行ったリハーサルのバトルでは、拙いチームワークでどうしても村に被害を出してしまう問題が発覚。ヒロトは、村に損害を出すことなくクリアする秘策を皆に提案する。 脚本：山田靖智／絵コンテ：大嶋博之／演出：大嶋博之／キャラクター作画監督：斉藤香、大籠之仁／メカ作画監督：高瀬健一

フレディのミッションをＧＢＮで導入された長編ストーリーミッションだと考えた４人は、ミッションの継続を決める。フレディに紹介されたレジスタンスのメンバーから、彼らが展開している反攻作戦の計画内容を聞くビルドダイバーズ。次の任務は、砂漠に存在するヒトツメの巨大基地の攻略に関わる陽動作戦だった。 脚本：樋口達人／絵コンテ：児谷直樹／演出：児谷直樹／キャラクター作画監督：しんぼたくろう／メカ作画監督：重田智

作戦当日、遅刻して現れたパルヴィーズは、これまでの自身のふがいなさを嘆き、ビルドダイバーズを抜けたいという旨をメンバー全員に伝える。必死に引き留めようとするカザミ、冷静なメイ、そしてどこまでも現実的なヒロト。パルヴィーズの決意は固いが、その意思に反して強制的にミッションは開始される。 脚本：ヤスカワショウゴ／絵コンテ：寺岡巌／演出：中原れい／キャラクター作画監督：高見明男／メカ作画監督：阿部宗孝、山根理宏

前回のミッションで１つ大きな成長を果たしたパルヴィーズ。しかし、カザミは自身が活躍できていないことに１人憮然としていた。そんなビルドダイバーズは、フレディの兄、ジェドがいるレジスタンスの基地へ出向くことになる。 脚本：イシノアツオ／絵コンテ：大久保朋/久藤瞬／演出：大久保朋／キャラクター作画監督：大貫健一、石井久美、大籠之仁／メカ作画監督：松田寛

ゴジョウからカザミのことを頼まれたヒロトだが、その真意をどうしても理解できない。一方のカザミも、自身の理想とは大きくかけ離れた現実との溝を埋める方法を見つけられず、ただもがくばかり。そんな危ういチームワークの中で、護衛・撤退戦のミッションが始まろうとしていた。 脚本：山田靖智／絵コンテ：小林寛/斉藤哲人／演出：小谷野竜成／キャラクター作画監督：むらせまいこ、野崎真一／メカ作画監督：宇田早輝子、久壽米木信弥

少しだけ、しかしとても貴重な前進をしたヒロトとカザミの関係性だったが、謎のガンプラ「ゼルトザーム」の急襲によりビルドダイバーズとレジスタンスは壊滅状態になってしまう。ムランがヒロト達に託したペンダントが逆転のカギになるのだと言うが……。メイは、マギーの店で情報収集を開始する。 脚本：樋口達人／絵コンテ：イムガヒ／演出：イムガヒ／キャラクター作画監督：中本尚子、斉藤香／メカ作画監督：高瀬健一

ヒロトの盾となって攻撃を受け、大破するウォドムポッド。その中から現れたのは、モビルドール姿のメイ。彼女はGBNが生み出した電子生命体、ELダイバーだった。残りのビルドダイバーズのメンバーが驚きの反応を示す中で、モビルドールメイはガンダムゼルトザームに攻勢をかける。

宇宙（そら）渡しの祭りを終え、次のミッションに向かうビルドダイバーズとレジスタンスの一行。目的の軌道エレベーターへ続く地上ステーションのロビーに設置された扉をある方法で開けたヒロト達は、その先へ進むための準備を改めて行うために、一旦ログアウトする。ラストミッションかも知れない次の舞台は、宇宙だった。 脚本：イシノアツオ／絵コンテ：斉藤哲人、児谷直樹／演出：児谷直樹／キャラクター作画監督：高見明男、石井久美、小暮昌広／メカ作画監督：阿部宗孝

アルスと名乗る存在との互いにかみ合わぬ会話の中、一旦月から離脱したビルドダイバーズを待ち受けていたのは、凄まじい数のヒトツメ、それらを従えるように佇むガンダムゼルトザーム。そしてさらに、ヒロト達を驚愕させる存在が現れた。 脚本：山田靖智／絵コンテ：大張正己、久藤瞬、綿田慎也／演出：久藤瞬／キャラクター作画監督：野崎真一、しんぼたくろう（中村プロ）／メカ作画監督：松田寛、久壽米木信弥、山根理宏