カスミも一緒に旅をすることになったサトシとピカチュウ。かつての旅の仲間である、タケシとデントと再会する。しかし、タケシは失恋したばかりでひどく落ち込んでいるようで…。すると突然野生のブリムオンが、タケシを連れ去ってしまう…！その理由は！？サトシ・カスミ・デントはタケシを取り戻すことができるのか！？

旅を続けるサトシとピカチュウたちは、世にも珍しいと言われる「コイキングのたきのぼり」を見るため、とある山を訪れる。そこで、1匹のツンベアーと出会うことに。強力な氷のパワーで周りのものを全て凍らせるツンベアーを見て、興奮するサトシ。しかし、ツンベアーは何やら悩みを抱えている様子で…？

港町にやってきたサトシとピカチュウたち。人だかりを覗いてみると、かつて共に旅をしたゼニガメ率いる、ゼニガメ消防団のショーが行われていた！今やゼニガメ消防団はたくさんの人に愛される人気者になっていたのだ！！ショーを楽しむサトシたち。一方、ロケット団はゼニガメ消防団のマネージャーになって何やら企んでいるみたい…！？

旅の途中、のどかな自然の中でまどろんでいたサトシたちをロケット団が襲う。何とか撃退したものの、ロケット団と一緒にピカチュウまで空の彼方に飛んで行ってしまった！離れ離れになったサトシとピカチュウは合流しようと、お互いを捜すが…。離れていても心は１つ―。ふたりは再会することはできるのか…！？

サトシとピカチュウは、かつて一緒に旅をしたラプラスと再会する。ラプラスは何やら助けを求めている様子…。ラプラスに案内されてやってきた島には、なんと洞窟の穴にはまって抜けられなくなったホエルコがいた！あの手この手でホエルコを穴から出そうとするが、果たして救い出すことができるのか！？

ある街にやってきたサトシとピカチュウたち。街では最近、あちこちの家で怪奇現象が起きているという。事件解決のために、サトシたちも事件現場の家を捜索するが、そこで目撃したのは1匹のジュペッタだった…！侵入した家から色んな物を持ち出していたジュペッタの目的は一体！？

ムサシ・コジロウ・ニャース・ソーナンスの元に、ロケット団本部からデリバードがやってくる。デリバードが届けに来たのは、ロケット団が各地方でゲットしたポケモンたちだった！懐かしい仲間達との再会を喜ぶロケット団。そして、ロケット団のこれまでの全てを懸けたピカチュウゲット作戦が、今、始まる―！？

サトシとピカチュウの前に、再びラティアスが姿を現す。ラティアスの「ゆめうつし」でサトシたちが見たのは、ラティオスに襲いかかるポケモンハンター！ラティオスを救うため、ラティアスとともに向かうサトシとピカチュウたち。果たしてラティオスを救い出すことはできるのか！？ 拉帝亚斯终于再次于小智和皮卡丘面前现身。并利用“梦境转映”让小智看到攻击拉帝欧斯的宝可梦猎人。 为了拯救拉帝欧斯，与拉帝亚斯一起前往的小智和皮卡丘。究竟能否救出拉帝欧斯呢？

チャンピオンになったキミは、どこまでポケモンマスターに近づけたのかな―。マサラタウンに帰ってきたサトシとピカチュウは、再会したシゲルに問いかけられる。ピカチュウと旅に出た時から、ずっとめざしてきた夢、ポケモンマスター。その答えを、サトシは見つけることができるのか―！？ 回到真新镇的小智和皮卡丘，与小茂再次见面，然而小茂问了一个问题：“成为冠军的你，距离宝可梦大师还有多远呢？” 和皮卡丘一起出发旅行开始，小智就一直以成为宝可梦大师为目标。小智能否找到这答案呢？