分别半年后，由于擅自使用军队的迫击炮，蕾娜从少校降级到上尉，不过她心怀辛他们先锋战队的遗志，至今仍指挥新的部队与〈军团〉作战。而且在「特别侦查任务」中与〈军团〉交战至倒下的辛等人，虽身负重伤，但在他们恢复意识之后，等待他们的将是……

被吉亚迪联邦保护了一个月，辛等人要么打工，要么上烹饪课，过着「普通少年、少女」的日子。大街上各处都是他们迄今为止未有过的「安稳日常」。然而，他们眼观这一切的表情似乎有些阴沉……他们随心所欲地见识城市的情况，并下定了决心。

辛等人决定入学特别军官学校。曾作为先锋战队的一员从残酷战场生存下来的辛，在特军校也发挥出自己的战斗能力，让周围的同学都感到惊讶。不过，作为习惯了战斗的〈八十六〉，从辛的眼神绝对不只找得到温暖。在这样的情况下，在鄂北分配到的部队中，辛与在图书馆相遇的青年・尤金重逢了……

从特军校毕业后，辛等人因为其优异的战斗能力，每天都被派往救援其他部队。久违被召集到基地的他们，从格蕾特那听到了〈军团〉即将发起大规模攻势的预测。已经察觉到〈军团〉动向的辛，向格蕾特等人汇报〈军团〉数量远超他们想象。

〈军团〉的大规模攻势终于开始了。在出击阵地，北极光战队的队员们目睹的是淹没地平线般涌来的〈军团〉大军。在兵力与攻击力都远超联邦军的〈军团〉齐攻之下，西部战线……

虽然击退了大规模攻势，但因为突然射来的远距离炮击，吉亚迪联邦的前线部队遭受巨大的损失。根据推测，敌军的武装是「电磁加速炮」。曾沉重打击辛等先锋战队的、弗雷德莉卡的骑士……面对前所未有的强大〈军团〉，联邦作出了某个决定。联邦军人被明日可能迎来死亡的紧迫感缠绕，但辛却显得一副心不在焉的样子……

为讨伐〈电磁加速炮型（闪蝶）〉，辛等北极光战队的十五人被选出参与孤军突破〈军团〉控制区的决死作战。〈八十六〉少年少女们艰难抵达了联邦，却依然站在了最前线，参与九死一生的作战。弗雷德莉卡为这场把性命抛在一旁的作战愤愤不平……

为了保护故乡和家人，联邦军没有撤退。他们在前线与敌死斗的模样，也通过无线电传达给了辛等人。纷纷调零的士兵们相信〈八十六〉会开辟出一条活路的。不过在〈尼塔特〉前进的路上，也有无法回避的〈军团〉挡住去路。为了避免战斗，将辛他们送到〈闪蝶〉那边，格蕾特……

在之前的大攻势和反击闪蝶之战，辛都发生了异常。面对让人联想到与哥哥战斗时、浑身开始散发着危险的辛，莱顿告诉他要带着弗雷德莉卡一起撤退。失去了在联邦得到的新同伴，他再次承担起“死神”的职责。自己托付的蕾娜如今生存的希望渺茫，能让失去依托的辛维持下去的东西是……

集各国之全技，反击〈闪蝶〉作战将至。担任先锋的是〈八十六〉少年少女们。不过前往〈闪蝶〉的路上，有多重〈军团〉的攻击所挡。为多让一个人抵达目标，同伴们承担诱饵之职，不断减员……在他们赌上性命开拓的道路前方，辛终于与〈闪蝶〉对峙了……

虽然一路上与同伴分别，但辛最终来到了〈闪蝶〉那边，继续着他们的决死攻防战。这时候突然降下的小口径榴弹支援炮击以及弗雷德莉卡的决死行动，让〈闪蝶〉露出了些许破绽。辛穿越〈闪蝶〉从高处倾泻而下的钢丝的斩击，飞到了它的上方，对着囚禁着桐谷的中央处理器打出了最后一击。不过在他准备叩响扳机的那一瞬间，辛的耳中听见了一个“声音”……

成功完成〈闪蝶〉讨伐作战，辛他们履行了「活着回到联邦」的约定。讴歌了短暂的休息之后，希望重返前线部队的他们收到了厄伦斯特的通知。越过共和国的绝命战场，在他们费劲来到的联邦有新的相遇。战斗、苦恼、以及在前方望见的一丝希望，少年少女们的故事开始一步步向前进展。在他们不断前行的旅途尽头，映入眼帘的是……