木之本樱，是充满活力的小学4年级学生。有一天，小樱在地下室发现一本闪闪发光的书。那本书中被称为“库洛牌”的不可思议的卡片被封印了。小樱在偶然的瞬间解开了封印，牌哗啦哗啦地飞走了。最后出现的是“封印之兽”可鲁贝洛斯。

某一天，小樱去学校，校园的中央桌椅堆积如山。犯人究竟是谁？或许，是库洛牌搞的鬼？为了查明，小樱与小可以及朋友知世在晚上一同来到学校……在那里看见的东西是？

小樱在社会学科去水族馆参观，看到了奇怪的水的事故。好像又是库洛牌搞的鬼。小可对“很难抓住‘水’”很在意。同时小樱崇拜的雪兔哥也被邀请约会，小樱十分开心。

星期日，小樱看家，在家里找到了2张库洛牌。小樱将牌放在地下室，把父亲遗忘的东西送去，回来时看见的是房间里长满的树枝！

在友枝小学上学的路上，有家布偶店。小樱等人看到温柔的店长和可爱的玩偶们，十分开心。但是，这家店的玩偶们好像有哪里不对劲！店长称，卖出的玩偶都回到了店里。

学校后的树林有幽灵出没。小樱和朋友们一起去看，真的看见了一个幽灵般的女人。为了调查是否是库洛牌搞的鬼，小樱在晚上再一次去看树林，不过，在那里出现的是本已去世的母亲！

在美术馆，小樱遇见了破坏画的男孩。他说了“爸爸创作的画被随意修改了，所以想改回去”之类的话。难道是库洛牌搞的鬼吗？为了查实，小樱晚上来到了美术馆。

小樱的班级，从香港来了一名转学的男生李小狼。小狼一直盯着小樱，令小樱有些招架不住。并且，他知道小樱有库洛牌，令她交出牌。神秘转学生的真实身份，究竟是？

小狼所说“（小樱）没有办法收集库洛牌”的话，令小樱很沮丧。感到担心的知世与利佳，与小樱去购物。三人一同在漂亮的小物件中挑选各自喜欢的胸针，利佳立刻买下，但好像有哪里不对劲。突然，她向小樱袭击了过来！

今天是友枝小学的运动会。崇拜的雪兔前来助威，令小樱干劲十足。到了中午，小樱第一次与知世的妈妈见面，不过知世的妈妈和小樱的爸爸好像认识。看着知世的妈妈看见爸爸时可怕的表情，小樱很是为难。

“有些麻烦的事，所以到我家来吧。”知世拜托小樱。小樱和小可同去，漂亮的大房子吓了他们一跳。存放着知世和知世的妈妈重要东西的箱子突然间打不开了。小可说从箱子里传来了库洛牌的气息。

音乐课上，小樱的笛子考试失败了。可是，第二天到学校，又是相同的笛子考试。似乎1天在重复着，然而注意到此事的只有小樱和小狼。果然是库洛牌搞的鬼吗？

公园的企鹅大王滑梯，一天早晨颠倒了过来！如此又大又重的东西，究竟是谁？要做什么？事件成为电视上新闻中的大骚动。那天小樱去动物园郊游，眼前奇怪的事接连发生……

小樱从雪兔那里拿到了学园祭的门票，于是和知世一起，来到桃矢和雪兔就读的高中。跟随雪兔的带领，小樱非常开心。随后，去看桃矢和雪兔演出的剧目《灰姑娘》，在那里，发生了事件。

一天晚上，小可和小樱吵架了。第二天，本想和解对话，但小可从小樱的抽屉里随便拿出东西在里面做了自己的房间。二人又生气吵架了，小可离家出走。晚上，作出反省的小樱等着小可回家，可那个时候小可是在别人家。

小樱一家人来到了位于高原的别墅。雪兔也和小樱同去，令她很高兴。附近有间大别墅，正散步的小樱，和那间别墅里的老爷爷相处得很好。小樱第二天也得到了邀请去玩，从老爷爷那里听说了关于他孙女的事情。

小樱来到了临海学校。大家兴奋地进行沙滩排球等娱乐活动。但是，第二天晚上，小樱最讨厌的“试胆大会”开始了。她与知世两个人在洞穴中走着，周围的朋友却从眼前渐渐消失……

小樱与知世、桃矢、雪兔到月峰神社参加夏日祭典。雪兔送的红色水气球令小樱很开心。两个人走着走着，意外来到了神社的后面。那里有很多萤火虫般的光芒…

暑假的最后一天，为了完成读后感的小樱和知世去了图书馆。可是始终找不到课题图书《小猪物语》。原本小狼有这本书，但在交流喜欢的书的时候，转眼间就消失了！尽管马上就发现了，但想要徒手抓住却没那么容易。

进入新学期，小樱的班上转来了李莓铃。体育万能充满活力的莓铃说“小狼是我的未婚夫哦！”引起了同学们的注意。那天夜里，发生了格斗家袭击事件。小樱觉得是库洛牌需要封印起来，就出门了。这时，莓铃出现了……