恐怖组织动物解放同盟突袭了一家研究所，掳走了一只怀孕的黒猩猩。15年后，当晚诞下的人类与黒猩猩的杂交种"猩猩人"查理进入高中就读。他与露西成为朋友，但二人丝毫不知宁静的生活何等脆弱。

动物解放同盟袭击了纽约市，导致数人在爆炸中丧生。随着查理与该组织过往渊源的消息传出，镇上的居民开始怀疑他与恐怖组织存在关联。查理若无其事地照常上学，丝毫不知动物解放同盟已经为他布下陷阱。与此同时，露西被一名神秘男子搭讪。

露西在科恩伯格灵长类研究生见到了生下查理的黒猩猩伊娃。她还在那里认识了福勒医生，他告诉了她一些关于查理身世的秘密。之后，她受邀来到查理家中共进晚餐，汉娜借此机会庆祝查理交到了第一个朋友。他们并不知道，动物解放同盟的人正在暗中伺机而动。

查理突然失踪。就在伯特和汉娜四处寻找他时，他正冷静地与动物解放同盟的里维拉、李普曼和敏斯交涉。他向对方下达了最后通牒，就在事情看似要和平解决时，里维拉却突然做出了极端的举动。

在主张动物权利的国会议员达芙妮M利纳雷斯的帮助下，查理最终获释。然而，当他回到学校，曾经热情的欢迎如今变成了鄙视和诽谤。尽管如此，露西还是想办法帮助查理争取公民权利。

因为阻止了奥兹和学生活动分子盖尔的争端，查理再次引发强烈关注。盖尔非但没有感谢他，反而质问查理为何对动物权利漠不关心。对查理的立场深感失望后，盖尔在网络直播中吐露了自己身为活动分子的无力感。就在此时，他收到了一个神秘邀请。

一名蒙面男子在舒兹高中直播枪击学生，学生们陷入恐慌，全世界也在惊恐地看着这一切。菲利普格拉汉姆副治安官冲进学校，却震惊地发现查理在努力拯救伤者。 与此同时，露西遇到枪手，他准备向查理传递最后一条公开信息。

校园枪击案引发民愤，全国范围内针对素食主义者和活动分子的袭击不断增加。 随着对动物解放同盟的反对情绪高涨，查理保护枪手的虚假消息不胫而走，公众开始怀疑他与恐怖分子有牵连，最终导致一场与镇上居民的冲突。

露西遇到菲尔副治安官，将十年前泳池事件的真相告诉了他。就在菲尔开始审视自己对查理的看法时，汉娜发觉养子身上有一些变化。 那一晚，露西和查理像往常一样互发信息。然而，露西奇怪的回复引起了查理的怀疑。

查理只身前去营救被绑架的露西。在与全副武装的动物解放同盟成员交手后，他最终找到了与里维拉在一起的露西。里维拉很高兴见到查理本人，他向查理讲述了十五年前动物解放同盟在突袭中拯救夏娃的真相以及此事与查理的生父大卫格罗斯曼博士的关系。

救出露西后，查理返回家中，却发现那里已被大火吞噬。他冲入火海，想要救出父母，可惜为时已晚。 由于发现他们的死亡存在疑点，查理迅速消失在森林中，以此避开警察的追捕。当局发现里维拉也从羁押中逃走且下落不明，随即展开了搜捕行动。

父母双亡后，查理被菲尔副治安官和他的妻子格蕾丝收养。尽管媒体穷追不舍，菲尔也因为选择保护查理被停职，他们还是开启了新生活。 然而，查理要面对更多变化，因为最新的体检结果表明他的身体正在发生转变。

查理努力回归正常生活。在得知动物解放同盟最新的暴行后，全国上下陷入恐慌。不过，查理貌似并不在意，他去看望了生命垂危的生母夏娃。在露西找到帮助夏娃沟通的方法后，夏娃留给查理的遗言令所有人震惊不已。